La primera universidad tuvo lugar en el verano de 1979, bajo el nombre de Universidad de Verano Homosexual (UEH), por iniciativa de Grupo de Liberación Homosexual (GLH) de Marsella, y con el apoyo del alcalde Gaston Defferre.
Se reunieron 400 militantes, y fue entonces cuando se creó el Comité de Urgencia Anti-Represión Homosexual(CUARH). Le GLH de Marsella se encargó de la organización de tres ediciones de las U.E.H. en 1979, 1981 et 1983.
En 1999, después de una larga interrupción debida al desastre causado por la pandemia del SIDA, un colectivo reactivó la iniciativa bajo el nuevo nombre de Universidades de Verano Euro-mediterráneas de las Homosexualidades.
En 2003, sólo se celebró un fin de semana de UEEH bajo la forma de una asamblea durante la cual se definieron nuevas bases políticas, más orientadas hacia la autogestión y el feminismo. Se añadió un subtítulo al nombre de las UEEH, « Encuentros Lesbigaytransqueers », para subrayar el carácter no mixto de la manifestación.
Desde entonces, las UEEH se esfuerzan en funcionar según los principios de gestión colectiva y de intercambios de saberes, colocando la horizontalidad y la ausencia de jerarquización de los saberes en el centro del proyecto.
